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從“五個(gè)家族”到“兩個(gè)亞型” 新冠病毒變了嗎?

時(shí)間:2020-03-06 07:48:42|來(lái)源:中國(guó)新聞網(wǎng)|點(diǎn)擊量:32345

(抗擊新冠肺炎)從“五個(gè)家族”到“兩個(gè)亞型” 新冠病毒變了嗎?

中新社北京3月4日電 題:從“五個(gè)家族”到“兩個(gè)亞型” 新冠病毒變了嗎?

中新社記者 張素

從被比喻為“五個(gè)家族”,到被分析出“兩個(gè)亞型”,連日來(lái)圍繞新冠病毒的諸多研究背后是一個(gè)核心問(wèn)題:新型冠狀病毒變了嗎?

國(guó)內(nèi)外研究均指向病毒突變

3日刊發(fā)于《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》的《關(guān)于SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進(jìn)化》一文指出,通過(guò)對(duì)103個(gè)新冠病毒全基因組分子進(jìn)化分析可知,新冠病毒已演化出L和S兩個(gè)亞型。

論文通訊作者、北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息學(xué)中心研究員陸劍和中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所研究員崔杰發(fā)現(xiàn),新冠病毒已于近期產(chǎn)生149個(gè)突變點(diǎn),L和S兩個(gè)亞型的區(qū)別在于病毒RNA(核糖核酸)基因組的第28144位點(diǎn)。文章還得出S型相對(duì)更古老、攻擊性較小的結(jié)論。

來(lái)自中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)院、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心、加州大學(xué)洛杉磯分校等5家機(jī)構(gòu)的研究人員,2日共同在預(yù)印本網(wǎng)站bioRxiv在線發(fā)表了一項(xiàng)針對(duì)新冠病毒演化過(guò)程中的突變、重組和插入的研究。他們收集并分析了120個(gè)新冠病毒基因組序列,提出根據(jù)核苷酸位置8517和27641,病毒株可分為兩個(gè)主要類(lèi)別。

巴西科學(xué)家與英國(guó)科學(xué)家則合作發(fā)表了《南美洲首份新冠病毒報(bào)告》一文。這項(xiàng)研究采集了巴西圣保羅一名61歲男性患者的病毒基因,將其命名為““Brazil/SPBR1/2020”。這株巴西病毒的基因組與中國(guó)公布的“Hu-1參考菌株”相比有3個(gè)突變點(diǎn),但與從德國(guó)慕尼黑的患者身上提取的“德國(guó)/BavPat1/2020菌株”更接近。

再早之前,中國(guó)科學(xué)院西雙版納熱帶植物園等機(jī)構(gòu)的科研人員收集了93個(gè)新型冠狀病毒樣本的基因組數(shù)據(jù),他們得到58種單倍型,又將其分為ABCDE五組,后被形容為病毒的“五大家族”。

突變?nèi)绾巫??篩選標(biāo)準(zhǔn)不同

上述研究均明確病毒發(fā)生突變,但基于突變的歸納分類(lèi)并不一致。對(duì)此,一位長(zhǎng)期關(guān)注相關(guān)問(wèn)題的生物學(xué)家4日告訴中新社記者,病毒總會(huì)突變,分類(lèi)就像是把病毒過(guò)篩,而“篩子”的形狀、“篩孔”的粗細(xì),決定了劃分類(lèi)型和分類(lèi)數(shù)量。

這位生物學(xué)家強(qiáng)調(diào),真正得出確切的分類(lèi),還需將基因組序列變化與發(fā)病時(shí)間、發(fā)病地區(qū)、傳播路線、臨床表現(xiàn)等病毒在真實(shí)世界的表現(xiàn)對(duì)應(yīng)起來(lái)。

以科研團(tuán)隊(duì)對(duì)SARS(嚴(yán)重急性呼吸綜合征)病毒的追蹤為例。2004年1月30日,全國(guó)防治非典科技攻關(guān)組和廣東省防治非典科技攻關(guān)領(lǐng)導(dǎo)小組宣布,中國(guó)科學(xué)家經(jīng)過(guò)8個(gè)月的聯(lián)合攻關(guān),在流行病學(xué)和分子進(jìn)化概念上定義了2002/2003年間SARS流行的早、中、晚三期,也定義了每一階段的基因組分子標(biāo)記,由此解析出SARS冠狀病毒分子進(jìn)化規(guī)律。

需指出的是,相較于全球已有的新冠肺炎確診病例人數(shù)來(lái)說(shuō),目前僅有130余條基因組序列被分析和上傳。有學(xué)者呼吁對(duì)全球范圍內(nèi),特別是對(duì)武漢地區(qū)的新冠肺炎患者進(jìn)行大規(guī)模病毒基因序列分析,同時(shí)結(jié)合患者的發(fā)病情況開(kāi)展分析,才能得出更可靠的結(jié)論。

怎樣看突變?無(wú)需過(guò)度恐慌

得知新冠病毒發(fā)生突變,人們不免擔(dān)憂病毒是否已出現(xiàn)變異甚至是進(jìn)化?這里需先厘清概念,生物學(xué)大致將變異分為“突變”和“基因重組”兩方面。

《自然—微生物學(xué)》2月19日刊發(fā)的一篇來(lái)自耶魯大學(xué)、悉尼大學(xué)等高校科研人員的評(píng)論文章回答說(shuō):突變是病毒生命周期的一個(gè)自然組成部分,尤其對(duì)于RNA病毒來(lái)說(shuō),突變“見(jiàn)怪不怪”。突變可使病毒毒性增強(qiáng),也可使其減弱。而病毒的毒性和傳播方式等是由多個(gè)基因控制,換句話說(shuō),需要多個(gè)突變才能進(jìn)化。任何關(guān)于突變后果的說(shuō)法都需要實(shí)驗(yàn)和流行病學(xué)證據(jù),“不該對(duì)病毒突變感到恐慌”。

梳理近期研究也可發(fā)現(xiàn)一些“好消息”。來(lái)自中科院版納熱帶植物園的研究稱“新型冠狀病毒基因組沒(méi)有發(fā)生重組事件”;南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)者發(fā)現(xiàn)117個(gè)突變點(diǎn)相對(duì)均勻地分布在整個(gè)基因組,表明“尚未出現(xiàn)特別‘激進(jìn)’的變異之處”。中國(guó)—世界衛(wèi)生組織新型冠狀病毒肺炎聯(lián)合專家考察組也表示,新冠病毒尚未發(fā)現(xiàn)明顯變異。

中山大學(xué)附屬第三醫(yī)院感染科副主任、《國(guó)際病毒學(xué)雜志》副主編林炳亮4日對(duì)中新社記者說(shuō),發(fā)生突變可能改變病毒的致病性和傳播性,“理論上多數(shù)疾病經(jīng)過(guò)傳播,致病性會(huì)減弱,但有些也會(huì)增強(qiáng),比如更容易吸附細(xì)胞”,這將對(duì)防控和臨床產(chǎn)生影響,因此需要進(jìn)一步觀察和研究。(完)

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